Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PSDA5PKW4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSDA5PKW4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms