Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAK1Q9UPV9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAK1Q9UPV9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms