Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TNRC6BQ9UPQ9 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms