Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZNF346Q9UL40 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms