Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RIMS3Q9UJD0 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms