Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHORDC1Q9UHD1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHORDC1Q9UHD1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms