Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5BQ9UGL1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms