Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
APEX2Q9UBZ4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms