Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SH3BP4Q9P0V3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP4Q9P0V3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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