Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MKS1Q9NXB0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms