Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDIT4Q9NX09 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDIT4Q9NX09 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms