Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED17Q9NVC6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED17Q9NVC6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms