Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB6BQ9NRW1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB6BQ9NRW1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms