Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
UBQLN4Q9NRR5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UBQLN4Q9NRR5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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