Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FANCFQ9NPI8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FANCFQ9NPI8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FANCFQ9NPI8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FANCFQ9NPI8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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FANCFQ9NPI8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FANCFQ9NPI8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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