Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CHST11Q9NPF2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CHST11Q9NPF2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CHST11Q9NPF2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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CHST11Q9NPF2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CHST11Q9NPF2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CHST11Q9NPF2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CHST11Q9NPF2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CHST11Q9NPF2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CHST11Q9NPF2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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CHST11Q9NPF2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CHST11Q9NPF2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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