Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC3GQ9HC16 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms