Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSPNQ9HAW4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms