Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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BPESC1Q9GZL8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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BPESC1Q9GZL8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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BPESC1Q9GZL8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
BPESC1Q9GZL8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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