Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGDIB-201ENST00000228945 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590240.2-201ENST00000413370 894 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLGN4Y-AS1-201ENST00000434164 532 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359873.1-201ENST00000447908 764 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009502.2-201ENST00000452903 766 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00520-206ENST00000560336 883 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 BLOC1S6-208ENST00000565323 688 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 BACH1-AS1-202ENST00000615718 700 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms