Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
MAP1LC3CQ9BXW4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms