Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C9orf16Q9BUW7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms