Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR3CQ9BUI4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR3CQ9BUI4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms