Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
RETNLBQ9BQ08 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms