Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RBBP8Q99708 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP8Q99708 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms