Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLF6Q99612 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms