Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TCF12Q99081 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms