Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms