Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CAPNS2Q96L46 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CAPNS2Q96L46 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms