Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RNF185Q96GF1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms