Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SIRT1Q96EB6 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SIRT1Q96EB6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms