Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ROPN1LQ96C74 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms