Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ULK4Q96C45 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ULK4Q96C45 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms