Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEIL2Q969S2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms