Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms