Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHIPQ8WWQ0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHIPQ8WWQ0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms