Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM41Q8WV44 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM41Q8WV44 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms