Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMNTD2Q8IXW0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms