Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PPFIBP1Q86W92 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms