Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BHLHA9Q7RTU4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHLHA9Q7RTU4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms