Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FBXO42Q6P3S6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms