Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LETMD1Q6P1Q0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms