Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRNP1Q6NT89 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TRNP1Q6NT89 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms