Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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RTL6Q6ICC9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RTL6Q6ICC9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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