Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATG16L1Q676U5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms