Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FNDC7Q5VTL7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms