Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM78BQ5VT40 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM78BQ5VT40 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM78BQ5VT40 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM78BQ5VT40 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FAM78BQ5VT40 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM78BQ5VT40 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FAM78BQ5VT40 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FAM78BQ5VT40 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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FAM78BQ5VT40 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FAM78BQ5VT40 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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FAM78BQ5VT40 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM78BQ5VT40 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM78BQ5VT40 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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FAM78BQ5VT40 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM78BQ5VT40 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM78BQ5VT40 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM78BQ5VT40 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM78BQ5VT40 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM78BQ5VT40 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM78BQ5VT40 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM78BQ5VT40 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FAM78BQ5VT40 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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