Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM164Q5U3C3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM164Q5U3C3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms