Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms