Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEXMIFQ5QGS0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEXMIFQ5QGS0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms